Prema izveštaju Komisije Vlade Republike Srbije DT 72 broj 00-002/2003/86 od 13. avgusta 2003. godine, koji se nalazi u spisima Posebnog odeljenja Okružnog suda u Beogradu K.p.br.5/03, Komisija zadužena da ispita događaje iz novembra 2001. godine u kojima je učestvovala Jedinica za specijalne operacije (JSO), zaključeno je da se radilo o oružanoj pobuni čiji je kolovođa bio ovde osumnjičeni Milorad Ulemek. Dalje se navodi da je u toj pobuni osumnjičeni Ulemek pozvao pripadnike JSO „da napuste svoje radne obaveze i povuku se u kasarnu, uključujući čak i članove Jedinice koji su radili na neposrednom obezbeđenju određenih ličnosti, i da blokiraju neke saobraćajnice u Kuli i autoput kod Centra Sava“. Kao što je opšte poznato, pripadnici Jedinice opravdavali su svoju akciju time što su, navodno, na prevaru poslati da uhapse haške begunce, braću Banović.
Pobunu dalje opisuje Zoran Mijatović, bivši zamenik načelnika Službe bezbednosti, u iskazu koji je kao svedok dao 28. decembra 2004. godine na glavnom pretresu u predmetu protiv okrivljenog Ulemeka i dr. (K.p.br. 5/03 Posebnog odeljenja Okružnog suda u Beogradu; spis Specijalnog tužilaštva Kts.br.2/03 – u daljem tekstu K.p.br.5/03): „Svi su oni [pripadnici JSO] zvani u Kulu mobilnim telefonima na hitan sastanak, a onda su im, to sam kasnije saznao, oduzimani mobilni telefoni i oružje, oni su tamo stavljani u neke prostorije i iza toga su se morali saglasiti sa onim što je grupa ljudi koja je to organizovala [tražila], da prihvate, da stanu iza tih zahteva koji su tamo formulisani“.
U iskazu svedoka Vladimira Popovića, datom na glavnom pretresu u predmetu K.p.br.5/03, 16. maja 2005. godine navodi se: „Pored onoga, ja mislim da sam to prošli put detaljno objasnio. Mogu da ponovim do reči. Ko su, šta su, kakva je uloga tačno Milorada Lukovića [osumnjičenog Ulemeka], kakva je uloga ljudi iz Jedinice, da tu postoji desetak, petnaest, ne više, njih koji su tu uključeni ali da Legija tamo važi za apsolutnog gospodara kod svih i da, znači, bez obzira što je samo tih deset, petnaest ljudi uključeno u kriminal, ili dvadeset, ne znam već koliko, njih dve stotine gleda u Legiju kao Boga i, drugo, oni se plaše tog vrha.“
Isti svedok u istom postupku ovako opisuje profil pripadnika Jedinice: „Kod jednog dela, kažem kod velikog dela ljudi pripadnika JSO, to su uglavnom priprosti ljudi, to su ljudi koji nemaju školu, najveći broj njih nema završenu čak ni osnovnu školu… Njima su ovi koji su ih dovodili bili apsolutni vladari i gospodari… Taj broj ljudi je bilo vrlo lako, sa njima se vrlo lako instrumentalizovalo.“ Isti svedok u istom postupku je dana 13. aprila 2005. opisao pripadnike JSO na sledeći način: „Veliki deo pripadnika JSO su uglavnom priprosti ljudi, najveći broj njih nema završenu čak ni osnovnu školu. Dođete tamo u neko selo kod Knina, nađete nekog kome su ubili i oca i majku i brata i sestru i dete i mače i kuče, i njega ništa drugo ne interesuje sem da ide da se sveti. Takvi ljudi su uzimani. Najveći broj takvih ljudi je doveden posle u Beograd ili u Kulu. Njima su ovi koji su ih dovodili bili apsolutni vladari i gospodari.“
U istom predmetu K.p.br 5/03, tamo okrivljeni Saša Pejaković u svom iskazu kod istražnog sudije 23. maja 2003. godine ovako detaljnije opisuje pobunu: „Dok sam radio kod Spasojevića u obezbeđenju, Legija je jednom naredio da treba da idemo u Jedinicu u Kulu… Nakon što smo stigli u sedište JSO-a u Kuli, Legija je pozvao sve nas iz obezbeđenja, a bilo nas je oko 10-ak. Odmah je otpustio dvojicu-trojicu… koji su bili članovi JSO-a. Nama ostalim je saopštio da smo od ovog trenutka, ne mogu da se setim koji je izraz upotrebio, da li u pobuni ili u protestu, te da ko ne želi da učestvuje, može da vrati pištolj i službenu legitimaciju i da ide. Niko nije smeo da se usprotivi. Ne znam da li je Legija tada rekao razlog za pobunu.“
Nakon što je pobuna otpočela, svedok Goran Petrović, u vreme pobune načelnik Službe RDB, u predmetu K.p.br. 5/03, opisuje na koji je način Jedinica otkazala poslušnost: „Nakon toga u moju kancelariju, a kasnije sam saznao i u kancelariju ministra Mihajlovića koji je tada bio na nekom službenom putu, je stigao faks u kome otprilike piše, Jedinica za specijalne operacije je, kao što Vam je već poznato uradila jedan sraman čin, izdajnički i tako neke gluposti i da zbog toga otkazuje dalju poslušnost načelniku resora tj. meni i ministru unutrašnjih poslova, Dušanu Mihajloviću. Nakon toga ja sam pokušao da stupim ponovo u kontakt sa njima, međutim, već tada oni su, ne znam po čijem naređenju, pretpostavljam po naređenju onih koji su to sve organizovali, prekinuli sve veze, kako da kažem, sa spoljnim svetom, znači više se niko nije javljao na telefone u Kuli, ni specijale, ni obične telefone. Kasnije smo saznali da su svim tim pripadnicima Jedinice pokupili mobilne telefone i sve druge telefone zaključali.“
Sa svoje strane, njegov zamenik Zoran Mijatović, u istom predmetu svedoči da je „Jedinica odbila da primi Gorana Petrovića“, koji je pokušavao s njima da pregovara.
Prema iskazu ovde osumnjičenog Ulemeka (K.p.br 5/03, na glavnom pretresu, 14. juna 2004), potvrđuje se da se tadašnji komandant JSO, Dušan Maričić, odupirao pokušajima svojih starešina da smire situaciju: „Maričić [je] još jednom pokušao da stupi u vezu sa načelnikom službe… Načelnik službe ga je odmah odbio i rekao mu sa kojim je on pravom isključio sve veze u centru u Kuli i naredio mu je da odmah dođe u centralu službe u Beogradu… na šta je imao tu kraću prepirku sa načelnikom službe i uglavnom tadašnji komandant [to] nije hteo… Jedno dva sata posle toga pred kapiju centra je stigao tadašnji zamenik Mijatović i sa njim je u kolima bio tadašnji načelnik Sedme uprave Milorad Bracanović. Oni su hteli pošto poto da uđu u sedište jedinice… komandant nije hteo da ih primi, već im je odneo sastavljen na papiru zahtev od strane Komande… Mijatović je uzeo onaj papir i bukvalno ga bacio komandantu… i rekao mu je, vi nemate nikakvih prava za nikakve zahteve, ili odmah smirite ovu situaciju, ili ćemo drugačije da razgovaramo. Komandant Maričić… je tu ušao u verbalnu prepirku sa zamenikom i taj se sastanak završio, ako mogu da kažem, katastrofalno.“
Ovo potvrđuje i ondašnji pomoćnik komandanta za bezbednost JSO-a, Veselin Lečić, saslušan 10. novembra 2004. kao svedok u predmetu K.p.br 5/03, kada na pitanje Predsednika veća da li je bilo usmene naredbe da se Jedinica vrati u kasarnu, odgovara: „Pa, verovatno jeste, ako je komandant Maričić imao kontakte. Ja ne znam sa kim je sve u tom periodu, u toku protesta i u daljnjem delu protesta imao, ali verovatno je bilo ubeđivanja ili naloga da se prekine sa protestom i sećam se da je, kad smo bili na Gazeli, da mu je zamenik načelnika Resora, tada izdao jedan takav nalog, odnosno rekao mu da mora da prekine sa protestom. Tu je izašao zamenik načelnika Resora, baš je on izašao na Gazeli, jer on nije imao kontakt drugi sa Maričićem koji nije hteo, mislim, da sa njim razgovara u tom periodu. Ali, na Gazeli jeste, susreli su se i pričali su na tu temu.“
Ovom pobunom rukovodili su, prema iskazu Milorada Ulemeka, datog u predmetu K.p.br.5/03 na glavnom pretresu 13. jula 2004. pripadnici „Komande Jedinice za specijalne operacije. Znači, ovih šest najviših oficira tada po funkcijama… koji su faktički činili tu srž komande…“
Na pitanje člana veća Nate Mesarević ko su tih šest najviših oficira, ovde osumnjičeni Ulemek odgovara: „To je bio Maričić Duško, Jovanović Zvezdan, Petraković Mića, Krsmanović Dragoslav, Radić Dragiša i Veselin Lečić.“
Prema iskazu svedoka-saradnika Zorana Vukojevića u predmetu K.p.br 5/03, datog na glavnom pretresu 13. aprila 2004. godine, navodi se da je „Legija bio u to vreme u Kuli i rukovodio je pobunom.“ Sličnu ocenu daje i, u predmetu K.p.broj 5/03, tamo okrivljeni Saša Pejaković, saslušan kod Istražnog sudije 23. maja 2003. godine: „U toku ove pobune, kao što sam rekao, glavni stvarni komandant je bio Legija.“
Svedok Čedomir Jovanović, u istom predmetu, na glavnom pretresu 11. aprila 2005. potvrđuje da je tokom pobune pregovarao sa osumnjičenim Ulemekom u oficirskoj kantini JSO-a, kada se s njim dogovorio da u Kulu pozove Dušana Mihajlovića. Isti svedok navodi da je „Milorad Ulemek, od prvog do poslednjeg trenutka, komandant Jedinice za specijalne operacije… Maričić se plašio i njegove senke… Ono što je meni danas jasno i što je nama bilo jasno već u toku same pobune, zapravo jeste činjenica da se vrh Jedinice za specijalne operacije potpuno podredio neformalnom uticaju bivšeg komandanta Milorada Ulemeka…“
I sam Ulemek, saslušan kao okrivljeni u tom predmetu, na glavnom pretresu 14. juna 2004. godine, potvrđuje da je upravo on pregovarao u ime JSO-a: „Došao sam u Ministarstvo [unutrašnjih poslova]. Odveli su me direktno u kancelariju kod ministra… Tu su sedeli i Lukić i profesor Andrija Savić… Mi smo se tu dogovorili da Jedinica bude izmeštena iz resora državne bezbednosti, da se stavi pod direktnu komandu Vlade Republike Srbije, s tim što bi operativne ingerencije, znači nad Jedinicom, imao načelnik resora general Lukić i ministar Mihajlović…“
Slična je i ocena ondašnjeg ministra unutrašnjih poslova, Dušana Mihajlovića, data u istom predmetu u iskazu na glavnom pretresu 15. marta 2005. godine: „Prilikom same pobune i tih događanja oko pobune, prateći te razgovore koje su imali predstavnici Jedinice sa okruženjem, shvatili smo, bar ja, po prvi put sam shvatio, da veliki uticaj na komandu te Jedinice imaju… ne samo gospodin Luković (osumnjičeni Ulemek – primedba S.P.), nego i ovi koje spominjemo, Dušan Spasojević, Ljubiša Buha Čume i otprilike ta ekipa, jer se oni direktno pojavljuju u organizaciji i podršci te pobune.“